Você precisa de três sistemas principais:
ERP: para receber pedidos, gerar notas fiscais, emitir etiquetas e controlar estoque (ex.: Tiny ERP, Bling ERP);
Plataforma de e-commerce: para vender online (ex.: Shopify, Nuvemshop, Yampi);
Plataforma de fretes: para disponibilizar cotações e opções de frete com as tabelas da Enviagora (ex.: Frenet).